Пещеры коронавирусов: чем заразились китайские шахтеры и при чем здесь США

В 2012 году шесть китайцев заразились в заброшенной шахте тяжелой пневмонией. Трое из них умерли. В университете при больнице, где лечились заболевшие, предположили, что люди могли заразиться коронавирусом от летучих мышей. Пять лет уханьские специалисты брали пробы, обнаружили самый близкий к Covid-19 коронавирус, но заявляют, что так и не определили вирус, который подхватили пострадавшие в шахте. Это история дала повод США утверждать, что полученный от пострадавших вирус в анализах и мог быть мутировавшим SARS-CoV-2, а в Ухане произошла его утечка из лаборатории. В Соединенных Штатах при этом совсем не интересуются другой историей, связанной с самими американцами. В 150 километрах от шахты находится пещера, где уханьские ученые совместно с американцами параллельно обнаружили сотни коронавирусов у летучих мышей, некоторые из которых оказались предшественниками SARSr-CoV — причины первой коронавирусной вспышки. Тогда анализы животных и жителей близлежащих деревень доказали, что вирус рекомбинируется и передается напрямую человеку. И именно образцы этих коронавирусов оказались в США, где нью-йоркская EcoHealth Alliance экспериментировала с ними и создавала новые. Этот американо-китайский проект окутывает темная история с использованием образца коронавируса, взятого у заразившегося по неизвестной причине и умершего известного китайского профессора, который мог также участвовать в проекте.

Исполнительный директор американской Bioscience Resource Project Джонатан Латэм заявил The Daily Telegraph, что вирус SARS-CoV-2, вызывающий к Covid-19, мог появиться в человеке, который подхватил коронавирус в шахте на юге Китая в 2012 году.

«Много сотен мутаций произошли в одном шахтере, чтобы привести к образованию [вируса] SARS-CoV-2. Десятки лет [развития] уместились примерно в шесть месяцев. По нашей теории, аналогичная эволюция происходила внутри легких шахтеров после загадочной болезни в 2012 году, а утечка вируса [из лаборатории в городе Ухань] произошла из медицинского образца, полученного от инфицированных шахтеров», — сказал Джонатан Латэм.

Еще в июне раскрыть информацию о шести шахтерах, заразившихся неизвестным вирусом в 2012 году, потребовал от Китая главный инфекционист США доктор Энтони Фаучи.

Обвинения американской стороны строятся на диссертации «Анализ шести пациентов с тяжелой пневмонией, причиненной неизвестными вирусами» аспиранта первой больницы Куньминьского медицинского университета Ли Сюй. В своей работе молодой специалист изучает истории болезней шести человек, которые в апреле и мае оказались в медучреждении с диагнозом тяжелая пневмония. Все они работали в пещере-шахте и убирали фекалии летучих мышей для того, чтобы возобновить добычу меди. Там рабочие и заболели. Трое из них умерли.

«Основываясь на упомянутых случаях и связанных с ними исследованиях, неизвестный вирус, повлекший тяжелую пневмонию, мог быть коронавирусом SARS-like-CoV от подковоносых или других видов летучих мышей», — резюмировал Ли Сюй.

В Уханьском институте вирусологии подтверждали, что с июля по октябрь 2012 года получили 13 образцов сыворотки четырех пациентов от первой больницы Куньминского медуниверситета и тестировали их на наличие вирусов Эбола, Нипах и SARSr-CoV Rp3. Повторные исследования провели и в 2019 году. Однако результаты каждый раз были негативными, говорится в специальном приложении на сайте Nature, опубликованном в феврале 2020 года.

Интриги добавило то, что Уханьский институт вирусологии так и не определил вирус, которым заразились рабочие, но сообщил, что ежегодно в 2012—2015 годах брал в шахте по несколько раз пробы у летучих мышей и обнаружил в 1 322 образцах 293 коронавируса. Девять из них оказались бетакоронавирусами SARSr-CoVs, а один, RaTG13 (Ra4991), как оказалось позже, на 96.2% идентичен SARS-CoV-2, который вызывает Covid-19.

Профессор и директор Центра исследований зарождающихся инфекционных заболеваний Института вирусологии в Ухане Ши Чжэнли приводила в письменном ответе изданию Science мнение профессора Сиднейского университета Эдварда Холмса о том, что расхождение в геномной последовательности между SARS-CoV-2 и RaTG13 составляет не менее 20 лет. Другими словами, это минимальный срок, в течение которого обнаруженный коронавирус должен был мутировать, чтобы появился тот, который вызывает Covid-19.

Как бы то ни было, но именно история с шахтой у городка Тонгуань в Моцзян-Ханийском автономном уезде провинции Юньнань на юго-западе Китая вызывает больший интерес в США, чем альтернативная версия, связанная с пещерой Шитоу, которая расположена в 150 километрах от шахты. Возможно, потому, что у Тонгуаня работали только китайские специалисты, а вот в Шитоу Уханьский институт вирусологии с другими китайскими научными организациями проводил альтернативные исследования с американской Ecohealth — на средства Министерства здравоохранения США (HHS). И они вызывают не меньше вопросов.

Так, с 2011 по 2015 год в пещере Шитоу собрали 602 мазка и образца фекалий летучих мышей и протестировали их на наличие коронавирусов. «84 образца дали положительный результат», — говорится в работе «Открытие богатого генофонда связанных с SARS коронавирусов у летучих мышей позволяет по-новому взглянуть на происхождение коронавируса SARS» от 2017 года. Ученые уточнили, что в 64 случаях из 84 обнаружили коронавирусы. 11 оказались новыми для исследователей и позволили им заявить, что они обнаружили предшественников SARS-CoV, который вызвал в 2002—2003 годах в Китае первую вспышку атипичной пневмонии и повлек за собой смерть 774 человек.

«Мы предполагаем, что прямой предшественник SARS-CoV мог возникнуть после последовательных событий рекомбинации между предшественниками этих SARSr-CoV. Исследования проникновения клеток показали, что все три недавно идентифицированных SARSr-CoV с разными последовательностями белка S способны использовать человеческий ACE2 в качестве рецептора, что дополнительно демонстрирует тесную взаимосвязь между штаммами в этой пещере и SARS-CoV», — сообщили ученые.

«Мы обнаружили коронавирусы, которые имеют все генетические элементы исходного вируса, который привел к вспышке атипичной пневмонии… Они способны инфицировать и вызывать заболевания в модели гуманизированного SARS у мышей», — делился в Twitter глава Ecohealth Питер Дашак, иллюстрировав информацию фотографиями, как он посетил пещеру.

В марте 2020 года Ши Чжэнли рассказала изданию Scientific American, что у пойманных летучих мышей из пещеры Шитоу обнаружили сотни коронавирусов. Из них несколько были смертельно опасными для человека. И, находясь в такой близости от носителей коронавирусов, не надо быть торговцем дикими животными, чтобы заразиться, заметила она по поводу местных жителей и работников одной из соседних с пещерой шахт.

Имела ли в виду китайский ученый конкретные случаи или предполагала, неизвестно. Однако в 2015 году Уханьский институт вирусологии и Ecohealth осуществили совместный проект по сбору анализов у 218 жителей четырех деревень у пещер Шитоу и Янзи и выяснили, что коронавирусы постоянно рекомбинируются и передаются человеку прямо от летучих мышей. Такие выводы исследователи сделали на основании того, что у четырех мужчин и двух женщин анализы дали положительный результат на коронавирус.

«Наше исследование предоставляет первые серологические доказательства вероятной инфекции человека SARSr-CoV летучих мышей или, возможно, родственными вирусами», — говорится в исследовании «Серологические доказательства коронавирусной инфекции, вызванной SARSr-CoV летучих мышей, у людей», опубликованном в 2018 году.

В работе упоминается профессор Сяоянь Че из Южного медицинского университета в Гуандуне. В работе говорится, что она была больна коронавирусом и любезно предоставила ученым два положительных образца для исследований. В исследовании не указывается, как и когда профессор подхватила инфекцию.

Известно зато другое. В 2013 году, за два года до исследований жителей деревень у пещеры Шитоу, Сяоянь Че умерла в возрасте 51 года. Как говорится в прощальной статье ее студентов на сайте Sina, профессор была первым ученым, разработавшим первый тест как на SARSr-CoV, так и на птичий грипп, и занималась технологией антител и биотехнологией. Причиной смерти назвали рак желудка, который развился за четыре месяца.

Судя по логике американцев, эта история также должна была их заинтересовать. Во-первых, Covid-19 опасен именно осложнениями других болезней. Во-вторых, противоречие в дате проведения исследований и дате смерти профессора может объясняться тем, что в Ухане уже могли быть ее анализы, если она проводила эксперименты для американо-китайских проектов и заразилась во время них. В-третьих же, Гуандунский центр по контролю и предотвращению эндемических заболеваний был таким же прямым партнером по изучению коронавирусов Ecohealth, как и Уханьский институт вирусологии.

Однако в этом случае американской стороне, очевидно, уже пришлось бы искать источник Covid-19 и в самих США, куда Ecohealth вывозил образцы коронавирусов для экспериментов.

Как сообщало EADaily, в сентябре американская новостная организация The Intercept получила в свое распоряжение и опубликовала документы о том, как нью-йоркская EcoHealth Alliance за бюджетные деньги проводила масштабные исследования коронавирусов в Китае и создавала искусственные в США. 900 страниц детальной информации стали доступны The Intercept в рамках иска, который она подала к Национальным институтам здоровья (NIH) на основе закона «О свободе информации».

Сама опубликованная информация содержит пакет документов о гранте Министерства здравоохранения США (HHS) «Понимание риска вирусной опасности летучих мышей», который оно выделило EcoHealth Alliance. Речь идет об исследованиях, которые проводили в 2014—2019 годах на сумму $ 3,1 млн, из которых около $ 750 тыс. получил Уханьский институт вирусологии.

Кроме него, основными участниками исследований также стали Восточно-Китайский педагогический институт из Шанхая, Юньнаньский институт по контролю и предотвращению эндемических заболеваний, Гуандунский центр по контролю и предотвращению эндемических заболеваний и Университет Северной Каролины.

Проект состоял из нескольких этапов. Первый — сбор анализов. Их собирались взять у тысяч летучих мышей, живущих в дикой природе на юге Китая, и у 1,66 тыс. человек, которые имеют отношение к охоте и торговле животными на рынках четырех провинций страны. У самих ученых, как говорится в документах, к тому времени уже были в распоряжении анализы более пяти тысяч летучих мышей и грызунов. Их получили во время предыдущих и текущих проектов, которые покрывали две трети территории Китая.

Судя по документам, собранные анализы должны были отправить в лабораторию Уханьского института вирусологии. Там ученые собирались обнаружить уже известные и новые коронавирусы, изучить возможность их межвидовой передачи и провести эксперименты на мышах, заразив их WIV1, который на 99,9% совпадает с коронавирусом атипичной пневмонии (SARS-Cov). После чего материалы из Уханя должны были отправиться в США.

«Моя лаборатория уже установила несколько первичных клеточных линий летучих мышей, способна сгенерировать псевдовирусы, и у нас есть опыт в каждой лабораторной технике, которая требуется для этого проекта», — говорится в отдельном сообщении профессора Ши Чжэнли.

Проект не ограничивался одними исследованиями, а предполагал и создание искусственного вируса и его проверку на заражение человека.

«Наш проект направлен на понимание риска заражения человека коронавирусом SARS летучих мышей. Мы создадим химерный SARSr-CoVs и оценим его способность инфицировать клетки hACE2, bACE2, cACE2 Vero, Hela, первичные эпителиальные клетки дыхательных путей человека и, возможно, клетки CaCo. Затем для оценки патогенности и клинических признаков мы проведем экспериментальное инфицирование мышей», — приводятся в документах планы EcoHealth Alliance.

Они осуществились. Уже в ноябре 2015 года на сайте Национального центра биотехнологической информации США (NCBI) появилось исследование «SARS-подобный кластер циркулирующего коронавируса летучей мыши представляет угрозу человечеству». В нем ученые Университета Северной Каролины, Гарвардской медицинской школы, Национального центра токсикологических исследований, питания и медикаментов, Швейцарского института микробиологии и лаборатории специальных патогенов и биобезопасности Уханьского института вирусологии сообщили о создании химерного вируса — из поверхностных белков SHC014 и вируса SARS, адаптированного для того, чтобы вырасти в мыши и мимикрировать в человеческое заболевание.

«Появление тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса (SARS-CoV) и ближневосточного респираторного синдрома (MERS-CoV) подчеркивает угрозу межвидовой передачи, которая приводит к вспышкам заболеваний среди людей. В работе мы исследуем потенциал вируса, подобного SARS, SHC014-CoV, который в настоящее время циркулирует в популяциях китайских подковоносых летучих мышей. Используя систему обратной генетики SARS-CoV, мы создали и охарактеризовали химерный вирус», — говорится во вступлении к исследованиям.

Что получили ученые, так это доказательство того, что химерный вирус может заразить человеческие клетки. В исследованиях говорится, что мыши подверглись эвтаназии, а все опыты с ними проходили непосредственно в Университете Северной Каролины в Чапел-Хилл.

Насколько вирус оказался опасным, можно судить по тому, что ученые выяснили: в мире не было ни профилактических, ни иммунотерапевтических средств для защиты от инфицирования.

«Оценка доступных иммунотерапевтических и профилактических методов на основе атипичной пневмонии показала низкую эффективность: они не смогли нейтрализовать и защитить от инфицирования CoV с использованием нового белка-шипа», — сообщили исследователи.

Искусственные вирусы в США продолжили создавать и после 2015 года. Так, на четвертый год исследований появились три новых химерных коронавируса (со спайк-белками SHC014, WIV16 и Rs4231), говорится в отчете EcoHealth в 2018 году. Вирусы также испытали на мышах и планировали создать еще и искусственный вирус ближневосточного респираторного синдрома (MERS). Но о его судьбе в документах ничего не говорится.

Профессор американской Школы системной биологии Университета Джорджа Мейсона вирусолог Анча Баранова заявила в интервью «Ленте.ру», что вирус мог эволюционировать в пробирке для получения различных мутаций. Как она считает, эксперименты могли проводить для создания вакцины, которая могла бы «перегнать» вирус: «[Для этого] его необходимо просто проэволюционировать в пробирке и посмотреть, что получится. Это называется эксперимент по приобретению функций».