Госкомиссия по делам религий Киргизии обнародовала список движений и организаций, которые по состоянию на конец 2015 года запрещены в стране. Запрет наложен в основном с формулировкой «экстремистские и террористические организации».
Суды различных инстанций Киргизии запретили деятельность следующих экстремистских и террористических организаций:
1. «Аль-Каида»* — Решением Первомайского суда Бишкека от 15 сентября 2006 года.
2. «Движение Талибан»* — Решением Первомайского суда Бишкека от 15 сентября 2006 года.
3. «Исламское движение Восточного Туркестана» — Постановлением Верховного Суда от 20 августа 2003 года.
4. «Курдский народный конгресс» («Конгра-Гель») — Решением Первомайского суда Бишкека от 11 июня 2008 года.
5. «Организация освобождения Восточного Туркестана» — Постановлением Верховного суда от 20 августа 2003 года.
6. «Хизбут-Тахрир-аль-Ислами» — Постановлением Верховного суда от 20 августа 2003 года.
7. «Группа джихада» («Союз Исламского джихада») — Решением Первомайского суда Бишкека от 11 июня 2008 года.
8. «Исламская партия Туркестана» (Исламское движение Узбекистана) — Постановлением Верховного суда от 20 августа 2003 года.
9. «Церковь объединения» (церковь Муна) — Решением Свердловского районного суда Бишкека от 22 февраля 2012 года.
10. «Жайшуль Махди» — Решением Первомайского районного суда Бишкека от 24 октября 2012 года.
11. «Джундь-аль Халифат» (Джунд-аль Халифат) — Решением Первомайского районного суда Бишкека от 24 октября 2012 года.
12. «Ансаруллох» (Ансарул Аллах) — Решением Первомайского районного суда города Бишкек от 24 октября 2012 года.
13. «Ат-Такфир Валь-Хиджрໆ (Ат-Такфир ва-л-Хиджра) — Решением Первомайского районного суда Бишкека от 24 октября 2012 года.
14. «Акромия» — Решением Первомайского районного суда Бишкека от 14 марта 2014 года признал религиозное движение «Акромия» экстремистской организацией и запретил на территории Кыргызстана.
15. Агитационно-пропагандистские материалы и пропагандистская деятельность А. Тихомирова — Саида Бурятского — Решением Октябрьского суда Бишкека от 14 марта 2014 года.
16. «ИГИЛ»* — Решением Октябрьского суда Бишкека от 13 февраля 2015 года.
17. «Джабхат ан-Нусра» — Решением Октябрьского районного суда Бишкека от 23 июня 2015 года.
18. «Катибат аль-Имам аль-Бухари» (Батальон Имама Бухари) — решением Ошского городского суда от 13 мая 2015 года.
19. «Жаннат Ошиклари» (Поклонники рая) — Решением Ошского городского суда от 13 мая 2015 года.
*Террористическая организация, запрещена на территории РФ
†Экстремистская организация, запрещена на территории РФ