17 декабря 1637 года в период сёгуната Токугава, в княжестве Симабара на японском остров Кюсю началось восстание крестьян, которые в большинстве своём были христианами. Восстание продлилось четыре месяца и было подавлено войском сёгуна в апреле 1638 года.
Симабара являлась одним из центров католического христианства в Японии начиная с середины XVI века. В 1587 году, после указа Тоётоми Хидэёси об изгнании из страны иезуитских миссионеров, некоторые христианские священники тайно скрывались в этой местности и способствовали росту христианской общины.
В 1596 году японское центральное правительство начало массовые репрессии против христиан, которые продолжались до начала 1630-х годов. Особенно жестокий характер они приобрели после основания сёгуната Токугава и прихода к власти сёгуна Токугава Иэмицу, который взял курс на изоляцию Японии от Запада.
Гонения на христиан совпали с разрушительными тайфунами и продолжительной (1633—1637) засухой, вызвавшей голод. Несмотря на это, налоги не снижались и продовольствие изымалось силой.
Восстание началось 17 декабря 1637 года на острове Кюсю, а затем распространилось на острова Амакуса. По некоторым оценкам, число восставших уже на начальном этапе достигло 23 000 крестьян и ронинов, включая и женщин. Восстание возглавил шестнадцатилетний юноша Амакуса Сиро, взявший себе христианское имя Иероним. Местные христиане считали его новым Мессией и рассказывали о нем чудеса.
Правитель Нагасаки, послал против восставших 3000 самураев, но повстанцы почти всех их перебили, после чего захватили замок Хара на полуострове Симабара. Вскоре на стенах замка появились христианские знамёна и большие деревянные кресты, и он превратился в главный оплот сопротивления.
Местные феодалы оказались не в состоянии подавить восстание и запросили помощи у сёгуна. В январе 1638 года войска сёгуната стали прибывать на полуостров и вскоре осадили Хару. Героическая оборона крепости продолжалась несколько месяцев, осаждающие несли потери, но войска сёгуна продолжали прибывать.
К марту 30 000 осаждённым крестьянам противостояло двухсоттысячное самурайское войско. К тому же у повстанцев заканчивалась пища и боеприпасы. 12 апреля 1638 года начался общий штурм, 15 апреля крепость Хара пала.
После подавления восстания было обезглавлено более 37 000 повстанцев и сочувствующих. Голову Амакусы Сиро привезли в Нагасаки. Крепость Хара была сожжена и полностью разрушена. Сёгунат запретил исповедовать христианство в Японии.
Однако полностью искоренить христианство японским властям так и не удалось. На севере Кюсю и в прилегающих районах Хонсю сохранились немногочисленные общины тайных христиан, иногда маскировавшихся под те или иные буддийские секты.
Лишь после крушения навязанной сёгунатом политики самоизоляции скрытые христиане вышли из подполья.