Депутаты сената (верхней палаты) парламента Казахстана ратифицировали протокол о внесении изменений в соглашение между Казахстаном и Россией о статусе города Байконур, порядке формирования и статусе его органов исполнительной власти от 23 декабря 1995 года.
Протокол был подписан в Астане 21 мая 2009 года.
Целью протокола является урегулирование вопросов двойного налогообложения, отмечается в заключении комитета по финансам и бюджету сената. По этому протоколу вносится дополнение, уточняющее правила налогообложения товаров, ввозимых в Байконур, или вывозимых оттуда. В случаях их вывоза с территории города Байконур на иную территорию Казахстана или ввоза товаров с иной территории Казахстана, они облагаются налогом на добавленную стоимость (НДС) по нулевой ставке и освобождаются от уплаты акцизов в отношении подакцизных товаров.
По словам министра финансов Бахыта Султанова, в протоколе заложен такой же принцип, который работает сегодня в Евразийском экономическом союзе (ЕАЭС): при реализации товаров с территории Казахстана в Байконуре обороты облагаются по нулевой ставке и НДС взимается один раз по ставке 18% и наоборот. Тот же подход использован на оказание услуг и выполнение работ.
Город Байконур и одноименный космодром входят в комплекс «Байконур», который находится в аренде у России до 2050 года. Город на период аренды комплекса в отношениях с Россией наделяется статусом, соответствующим городу федерального значения РФ.